Molekularni vodonik ima sposobnost selektivne neutralizacije toksičnih molekula (slobodnih radikala) na mestu povrede ili oštećenja, a mala molekulska masa omogućava brzu i duboku penetraciju vodonika u inače nedostupne tkivne prostore i ćelijske organele zahvaćenog tkiva.
Dosadašnja istraživanja nisu pokazala značajne neželjene efekte molekularnog vodonika.
Molekularni vodonik se može primenjivati na nekoliko načina – inhalacijom vodoničnog gasa, unosom oralnih rastvora (vode obogaćene vodonikom), intravenskim ili intraperitonelanim ubrizgavanjem vodonika ili direktnom aplikacijom u vidu kapi za oči, rastvora za kupke ili geloznih formulacija za primenu u vidu obloga i pakovanja.
Molekularni vodonik ima prednost sa aspekta toksičnosti – nije citotoksičan ni pri visokim koncentracijama.
Efekti molekularnog vodonika su poslednjih nekoliko godina aktivno istraživani u oblastima medicine koje se bave sistemom organa za kretanje – od ortopedije i sportske medicine do reumatologije i fizikalne medicine.